診断書に記載する氏名

お尋ねの件ですが、個人情報保護に係る問題ですので、慎重に対応したほうがよろしいかと存じます。
診断書は、記載した日の姓で記載するのが一般的と考えます。なお、「旧姓〇〇」としておけばよろしいかと。
当時の姓でも構わないと思うのですが、「新姓〇〇」としておきましょう。
いずれにしても、提出先で確認されると思うので、あまり気にすることはないと思います。
ただし、本人確認ですが、確実におこなうのであれば戸籍抄本（謄本）を提示いただくことですね。
本人確認を怠ったことで、その診断書が不正に使われる可能性があるので。
（回答者　ひできさん）